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A principal hipótese da polícia é que a vítima conhecia o autor do crime, pois vizinhos relataram ter escutado "conversas amistosas" na residência do padre por volta das 22h de quarta-feira, 23. Cerca de 30 minutos depois, a conversa teria encerrado, momento em que foram ouvidos barulhos de móveis caindo e sendo arrastados. Além disso, segundo o delegado, análises preliminares no local do crime não encontraram indícios de arrombamento na porta, o que indicaria que não foi premeditado.
De acordo com Fernandes, a primeira linha de investigação indica que o assassinato ocorreu após algum tipo de "desentendimento", seguido de uma luta, na qual o autor do crime teria utilizado uma faca de serra do próprio padre para atingi-lo repetidas vezes.